################################################### ### chunk number 1: ################################################### #line 6 "vignettes/bladderbatch/inst/doc/bladderbatch.Rnw" options(width=65) ################################################### ### chunk number 2: input ################################################### #line 41 "vignettes/bladderbatch/inst/doc/bladderbatch.Rnw" library(bladderbatch) data(bladderdata) # Get the expression data edata = exprs(bladderEset) # Get the pheno data pdata = pData(bladderEset)